学部は、総合科学部、医学部、歯学部、薬学部及び工学部の5学部から成っており、全学部の1、2年生は全学共通教育センターで一般教養等を学びます。

大学院は、総合科学教育部、医科学教育部、口腔科学教育部、薬科学教育部、栄養生命科学教育部、保健科学教育部、先端技術科学教育部の7教育部とソシオ・アーツ・アンド・サイエンス研究部、ヘルスバイオサイエンス研究部、ソシオテクノサイエンス研究部の3研究部から成っています。

平成24年度4月1日から、助産学専攻科を廃止し、保健科学教育部に博士前期課程助産学実践コースを新設しました。

医科診療部門と歯科診療部門があり、医科26診療科、歯科4診療科と45中央診療施設等があります。